生物醫藥產業建成抗腫瘤藥物、抗肝炎藥物、麻醉手術用藥、新型中成藥、新型藥用包裝材料、醫用消毒滅菌設備等六大生產研發基地，形成了化學藥品原料藥、化學藥品製劑、中成藥、生物藥、衛生材料和醫藥用品、醫療器械、藥用包裝材料、中藥飲片加工等八大產品群。重點醫藥企業建立了國內領先、接軌國際的創新研發體系，研發投入占銷售比重達到14%，遠高於國內其他重點醫藥城市。未來，圍繞打造國內一流、世界知名的「中華藥港」，大力發展化學藥、生物藥、中藥和新型醫療器械產業鏈。在化學藥領域，推動龍頭企業建立從高端中間體到化學藥品製劑一體化發展模式，高標準推進國家原料藥生產基地建設，逐步建立化學藥品製劑生產全產業鏈。在生物藥領域，圍繞惡性腫瘤、高血糖、心腦血管、自身免疫性疾病、血液病等生物藥防治優勢領域加快布局一批生物藥，打造以胰島素為先導、多管線齊發力的生物藥全產業鏈。在中藥領域，引導中藥材規範化種植養殖，圍繞金銀花、青蒿、白芍等核心中藥材品種，探索中藥企業與中藥材產地合作新模式，加快道地藥材種養殖基地建設，做優中成藥生產全產業鏈。在醫療器械領域，推動消毒滅菌設備等優勢產業加強技術攻關，提升產品市場競爭力，推動醫療器械產業鏈向高端化躍升。

重點企業：恒瑞醫藥、正大天晴、豪森藥業、康緣藥業、諾泰製藥、德源藥業、蘇雲醫療、佑源醫藥、福邦藥業、百侖生物反應器。

園區載體：市開發區、市高新區、灌雲縣臨港產業區、江蘇連雲港化工產業園區。

創新平臺：恒瑞醫藥國家認定企業技術中心、豪森藥業國家認定企業技術中心、康緣藥業國家認定企業技術中心、正大天晴藥業國家認定企業技術中心、豪森藥業長效多肽生物藥物開發國家地方聯合工程研究中心、康緣藥業中成藥智能製造國家地方聯合工程研究中心、恒瑞醫藥抗腫瘤靶向藥物國家地方聯合工程研究中心、恒瑞醫藥國家靶向藥物工程技術研究中心、省原創化學藥創新中心等。